Повышенное содержание аммония и аммиака в воде может вызывать неприятные запахи и вкус, делая её неприятной для употребления. Длительное использование такой воды нарушает баланс кислот и щелочей в организме. Аммиак также может серьёзно повредить слизистые оболочки глаз и другие ткани организма. Ионы аммония повышают уровень щёлочи в крови, что может приводить к недостатку кислорода в клетках (гипоксии). Избыточное количество аммония вызывает широкий спектр проблем, включая отёчность тканей, тошноту, дрожь, затруднения дыхания и даже спутанное сознание.
Кроме того, загрязнённая азотистыми соединениями вода негативно влияет на рыбоводство и содержание аквариумных рыб. В такой среде рыбы испытывают недостаток кислорода, что приводит к их гибели.